Den første russiske tsar, der ikke kom fra Rurik-familien, Boris Godunov, døde i en alder af 53 år den 13. april 1605. Hans død er omsluttet af hemmeligheder, og historikere argumenterer den dag i dag for, om hans død var naturlig eller voldelig.
Krønikedokumenter viser, at Godunov på dagen for hans død så sund ud, spiste med stor appetit og klatrede op i tårnet, hvorfra han elskede at undersøge Moskva. Så gik han ned fra hende og følte sig syg. Lægen, der blev indkaldt til tsaren, kunne ikke gøre noget, tsaren blødte fra hans ører og næse, snart var Godunov væk.
Som en af repræsentanterne for den engelske ambassadør Thomas Smith, der i det øjeblik var ved den russiske autokrats domstol, skrev, følte tsaren ud over kvalme og smerter i maven og døde, før lægen ankom.
Boris Godunovs pludselige død, mavesmerter giver grund til at mistanke om, at tsaren var forgiftet. Hans død var først og fremmest fordelagtigt for tilhængerne af False Dmitry I, hvis tropper nærmede sig Moskva på det tidspunkt.
Der var også et rygte blandt folket, at tsaren selv blev forgiftet i en fortvivlelseskræk forårsaget af hans upopularitet blandt folket, sult i landet og dets besættelse af polakkerne.
At kende Boris temperament, hans karakter, ønsket om den øverste magt, som han var klar til alt (han blev beskyldt for at forgifte Ivan den forfærdelige, mordet på Tsarevich Dmitry, søn af Ivan IV), og som han opnåede, blev de Faktisk hersker over Rusland under Fedor Ivanovich, kan du tvivle på versionen af Godunovs selvmord. Det russiske folk, hans opfattelse af tsaren, var sandsynligvis ligeglade med autokraten. Polakkernes fremskridt over hele landet kunne heller ikke skræmme tsaren, fordi der var endnu værre tider i russisk historie, lad os f.eks. Huske invasionen af de mongolske tatarer i Rusland.
Det bør ikke glemmes, at Godunov ofte var syg for nylig, og hans død kunne være resultatet af en lang sygdom hos autokraten.